Term Overlap P.value Adjusted.P.value Old.P.value Old.Adjusted.P.value Odds.Ratio Combined.Score Genes Mitotic Spindle 87/199 9.84977485848504e-11 4.92488742924252e-09 0 0 2.60814692844567 60.094280580917 CEP57;NUMA1;WASL;BRCA2;ARHGAP5;SMC4;PREX1;PCM1;CNTRL;NCK2;ARFIP2;CEP250;TLK1;KIFAP3;SPTAN1;CDK5RAP2;PLEKHG2;RFC1;CSNK1D;ACTN4;KIF22;SMC1A;DYNLL2;CKAP5;TUBA4A;CD2AP;LATS1;TIAM1;ARHGAP10;CLIP1;ALS2;RASA1;RASA2;ARHGEF3;MYH9;ATG4B;ARHGEF2;KIF20B;EZR;KPTN;ARHGEF7;SOS1;DOCK2;RAPGEF6;ARL8A;PAFAH1B1;NOTCH2;ROCK1;EPB41;TUBGCP2;PXN;TUBD1;NEDD9;KLC1;ABR;RHOT2;BCL2L11;KIF3B;EPB41L2;STK38L;CEP72;FLNA;CEP192;PCNT;MARK4;PDLIM5;SPTBN1;ARFGEF1;DYNC1H1;TBCD;RANBP9;ARHGAP27;HOOK3;SSH2;LRPPRC;NET1;CENPE;NIN;APC;PRC1;CENPJ;ABI1;NF1;TUBGCP5;TUBGCP3;RAB3GAP1;MAP3K11 p53 Pathway 78/200 3.46207088602025e-07 8.65517721505063e-06 0 0 2.14102393305801 31.850361720939 CYFIP2;RB1;APP;CCNK;BTG2;CD81;CCP110;ABAT;RRP8;PITPNC1;PIDD1;SEC61A1;SESN1;FDXR;KIF13B;CTSF;UPP1;IER5;CTSD;POLH;TSC22D1;PRMT2;APAF1;FBXW7;SPHK1;F2R;RHBDF2;AEN;CGRRF1;PRKAB1;DDB2;WRAP73;RAP2B;RAD51C;TRAF4;DDIT3;DDIT4;ANKRA2;TP53;ATF3;PPP1R15A;POM121;HDAC3;SLC35D1;RETSAT;PVT1;RGS16;NOL8;XPC;FOXO3;PPM1D;RCHY1;NDRG1;TOB1;CDKN2AIP;IRAK1;RAB40C;ZMAT3;MKNK2;RALGDS;IP6K2;PLK3;JUN;PMM1;GADD45A;ZBTB16;WWP1;DEF6;PTPRE;SP1;MDM2;FAS;ERCC5;COQ8A;MXD1;ADA;MXD4;RAD9A Protein Secretion 43/96 2.32304755519632e-06 3.8717459253272e-05 0 0 2.70841078449113 35.1352127094416 COPB2;STX12;SGMS1;COPB1;GOSR2;CLTC;USO1;ICA1;ATP1A1;CLCN3;NAPG;RPS6KA3;LMAN1;GOLGA4;AP1G1;LAMP2;ATP6V1H;MAPK1;ATP7A;DNM1L;YKT6;SEC31A;ARFGEF1;ARFGEF2;STX7;GBF1;COG2;ADAM10;AP3B1;AP2B1;STAM;SCAMP1;IGF2R;ARCN1;GALC;GNAS;YIPF6;VPS45;SEC22B;SEC24D;PAM;GLA;BET1 G2-M Checkpoint 75/200 3.28150503270722e-06 4.10188129088403e-05 0 0 2.00755048287972 25.349758299509 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0 0 1.88574494146244 15.3365666819811 PHF3;CDKN1B;CELF2;PTEN;ICA1;PIK3CD;PRDM2;NR3C1;SYNE1;NIPBL;SIPA1L1;ZMIZ1;SLC22A18;PIAS3;MIOS;SFMBT1;BCKDHB;ATRX;DYRK1A;RUNX1;TGFBR2;TGFBR3;RASA2;NOTCH2;YTHDC1;GCNT1;MRPS31;PIK3R3;ADD3;ATP2C1;SLC7A1;SCAF8;ATXN1;MTA1;GRK5;TOGARAM1;FYN;PDLIM5;LDLR;MAP2K5;SMAD3;MGMT;NEK7;NR1D2;SYNJ2;ATP2B1;MAPK14;NFKB1;PEX14;SMAD7;BHLHE40;CDK13 Interferon Gamma Response 67/200 0.000529269242879493 0.00240576928581588 0 0 1.68169986754792 12.6867661503027 OGFR;SAMD9L;EIF4E3;SPPL2A;TNFAIP3;ADAR;IFIT2;CASP8;NAMPT;DHX58;TRIM25;CD38;ITGB7;UPP1;JAK2;CMTR1;HERC6;ZBP1;IFNAR2;IL4R;SP110;IL15;DDX58;NCOA3;ARID5B;TAPBP;IRF4;IRF1;OAS3;PELI1;IRF7;TRIM14;IRF5;RAPGEF6;IRF9;MVP;DDX60;SAMHD1;HIF1A;RNF213;KLRK1;APOL6;ST8SIA4;ST3GAL5;RIPK1;PTPN1;PNPT1;GCH1;AUTS2;IL10RA;MX2;MX1;EIF2AK2;IFI44;PARP14;TOR1B;SOD2;PARP12;NFKB1;PML;NFKBIA;ZNFX1;FAS;CD69;XAF1;PTPN2;PFKP Androgen Response 38/100 0.000595969465630909 0.00248320610679546 0 0 2.04261042399725 15.1670383301738 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0.181318417254377 0 0 1.4991574754902 3.93347636226975 IDI1;STARD4;PCYT2;HMGCS1;CYP51A1;HMGCR;ANTXR2;HSD17B7;SREBF2;TM7SF2;FADS2;SQLE;ATXN2;NFIL3;FASN;TP53INP1;PDK3;SC5D;CTNNB1;MVD;GUSB;LDLR;ATF3 Adipogenesis 54/200 0.114038085060353 0.271519250143697 0 0 1.23015614103873 2.67094306947505 SLC27A1;LIPE;CPT2;DBT;ACADS;HIBCH;PHYH;CHUK;IFNGR1;APLP2;MCCC1;ELMOD3;ELOVL6;ATP1B3;SLC5A6;POR;PPM1B;ACOX1;GPD2;PREB;PPP1R15B;CD151;PFKFB3;RETSAT;BAZ2A;ABCB8;TANK;ADIPOR2;TOB1;AGPAT3;BCL2L13;GPAT4;DHRS7B;G3BP2;UBQLN1;RREB1;SLC19A1;STAT5A;ESRRA;PTCD3;GADD45A;RIOK3;IDH1;EPHX2;VEGFB;RMDN3;IMMT;COQ9;PEX14;CS;PFKL;LPCAT3;NMT1;ESYT1 Fatty Acid Metabolism 43/158 0.132090590622803 0.300205887779099 0 0 1.2431712217126 2.5165108514067 GCDH;IDI1;ACADVL;RETSAT;ECI1;ECI2;RAP1GDS1;ETFDH;CPOX;HSD17B4;DLST;ENO2;HSD17B7;ADIPOR2;PTS;HMGCL;HSPH1;CPT2;AUH;RDH11;IDH3B;MLYCD;KMT5A;ACAA1;ACSS1;ACADS;HIBCH;CPT1A;GABARAPL1;HSP90AA1;HMGCS1;ACSL1;ELOVL5;IDH1;NCAPH2;BCKDHB;ACSL5;ACSL4;ACOX1;GPD2;FASN;XIST;PPARA heme Metabolism 53/200 0.148705490784011 0.322130228294016 0 0 1.19882133718494 2.28469872028187 BTG2;NARF;TFRC;PIGQ;SLC2A1;CPOX;NR3C1;BACH1;NNT;LAMP2;BTRC;FBXO9;CAST;KHNYN;PPP2R5B;GAPVD1;TENT5C;RNF123;DAAM1;HAGH;KDM7A;SIDT2;EPB41;HTRA2;FOXO3;PPOX;CLCN3;ADD1;TRAK2;SEC14L1;MXI1;TSPAN5;DCAF10;CDR2;RIOK3;NEK7;FOXJ2;XPO7;ASNS;CTNS;FBXO34;ELL2;KLF3;UBAC1;RCL1;MFHAS1;SLC25A37;GCLC;SYNJ1;YPEL5;LPIN2;NFE2L1;PICALM Wnt-beta Catenin Signaling 13/42 0.154622509581128 0.322130228294016 0 0 1.48907573064918 2.77975974937053 MAML1;TCF7;PSEN2;CUL1;RBPJ;NCOR2;KAT2A;ADAM17;NUMB;CTNNB1;SKP2;TP53;PPARD Bile Acid Metabolism 30/112 0.209453747650372 0.418907495300744 0 0 1.21556289459874 1.90023153810149 IDI1;ABCD2;ABCD3;RETSAT;HSD17B4;CROT;PEX26;FADS2;LIPE;ATXN1;SLC22A18;FDXR;LONP2;HACL1;MLYCD;ABCD1;PEX16;PHYH;ACSL1;PNPLA8;IDH1;EPHX2;ACSL5;PEX13;GNPAT;NPC1;PEX6;NEDD4;EFHC1;PAOX Hypoxia 51/200 0.237842225099584 0.457388894422277 0 0 1.1374520090267 1.63354913768289 ERO1A;CDKN1B;HEXA;SLC2A1;TNFAIP3;IRS2;ENO2;RBPJ;NR3C1;ETS1;HK1;NDST2;GYS1;ZFP36;PDK3;IDS;ATP7A;SLC37A4;PDK1;JMJD6;ILVBL;DDIT3;DDIT4;MYH9;ATF3;PPP1R15A;KDM3A;PFKFB3;SDC4;CXCR4;FOXO3;NDRG1;NFIL3;MXI1;VHL;ANKZF1;JUN;MAP3K1;TIPARP;SIAH2;KLHL24;FOSL2;PFKL;KLF6;NAGK;P4HA1;XPNPEP1;BHLHE40;BCL2;PAM;PFKP Glycolysis 50/200 0.29191332579065 0.540580232945647 0 0 1.10740013097577 1.36353995434875 ERO1A;PYGB;B4GALT1;IRS2;PLOD1;ENO2;HS2ST1;GMPPB;GYS1;GMPPA;PDK3;QSOX1;ME2;GUSB;SLC37A4;CHPF2;GLCE;COG2;MED24;HAX1;DDIT4;B4GALT7;B4GALT4;GNE;COPB2;PAXIP1;IDUA;RPE;CXCR4;CLN6;PPP2CB;NT5E;FUT8;CHST12;MXI1;BPNT1;ANKZF1;GOT1;AGL;IDH1;PMM2;GFPT1;ECD;EXT2;GCLC;P4HA1;NASP;PAM;GALK2;PFKP Reactive Oxygen Species Pathway 13/49 0.338535998403716 0.604528568578064 0 0 1.19898585246138 1.29865136614281 TXNRD2;GSR;OXSR1;IPCEF1;SOD2;SCAF4;SBNO2;GCLC;STK25;ERCC2;NDUFS2;MBP;PFKP Inflammatory Response 49/200 0.351382158319508 0.605831307447427 0 0 1.07775892420962 1.12720744955348 BTG2;ATP2A2;AHR;BEST1;GPR132;IL18RAP;NAMPT;CCR7;IL4R;IL15;SPHK1;TNFRSF1B;TAPBP;TLR1;IRF1;IRF7;ITGA5;RAF1;RGS16;KCNA3;PSEN1;ATP2C1;HIF1A;SLC7A1;RASGRP1;PIK3R5;LDLR;CD55;SLAMF1;GCH1;SEMA4D;CCL20;CD70;IL10RA;TNFRSF9;EIF2AK2;ATP2B1;NFKB1;NFKBIA;P2RX7;PTPRE;KLF6;P2RX4;GPR183;ABI1;CD69;IL7R;MXD1;IL18R1 Notch Signaling 8/32 0.469773305940334 0.782955509900557 0 0 1.10642439974043 0.835909197572707 NOTCH2;KAT2A;FBXW11;PSEN2;CUL1;ARRB1;DTX2;PPARD IL-6/JAK/STAT3 Signaling 20/87 0.556402942662767 0.897424101068979 0 0 0.990622683589211 0.580764960947353 PTPN1;JUN;IL4R;ITGA4;IFNGR1;TNFRSF1B;CBL;IL17RA;PIK3R5;HAX1;IRF1;IL2RA;CD38;FAS;MAP3K8;IL12RB1;STAM2;IRF9;PTPN2;IL18R1 Xenobiotic Metabolism 44/200 0.677848544732619 0.999993155496853 0 0 0.935436266371518 0.363726994323187 CYFIP2;SLC46A3;ABCD2;SLC35D1;RETSAT;SLC35B1;ETFDH;ATP2A2;CROT;PTS;CNDP2;NFS1;SERTAD1;LONP1;ASL;HACL1;ACP2;MAN1A1;UPP1;PDLIM5;MCCC2;GSTM4;HES6;GABARAPL1;PMM1;GCH1;ELOVL5;GSS;IDH1;GSR;DHPS;DHRS1;AP4B1;POR;GCLC;NPC1;ACOX1;ID2;NMT1;FAS;ACOX3;GART;LPIN2;PPARD KRAS Signaling Up 44/200 0.677848544732619 0.999993155496853 0 0 0.935436266371518 0.363726994323187 ERO1A;PPP1R15A;SPON1;ABCB1;SATB1;RGS16;CXCR4;TOR1AIP2;TNFAIP3;IKZF1;CROT;PRDM1;CBL;ETS1;ANKH;AKT2;FBXO4;KCNN4;MAP4K1;ST6GAL1;RABGAP1L;MAP3K1;CDADC1;GALNT3;MMD;CCL20;IL10RA;ATG10;TRAF1;TNFRSF1B;DUSP6;GADD45G;WDR33;ADAM17;NIN;ID2;STRN;ADAM8;AVL9;IL7R;DOCK2;TRIB2;SDCCAG8;BIRC3 UV Response Up 34/158 0.716617027019014 0.999993155496853 0 0 0.909306209519532 0.302993298829964 BTG2;ABCB1;TFRC;AMD1;HNRNPU;DDX21;FURIN;ENO2;RASGRP1;RXRB;PPP1R2;BCL2L11;ACAA1;YKT6;MARK2;STARD3;RFC4;GCH1;PARP2;ASNS;SOD2;TUBA4A;RHOB;NFKBIA;NR4A1;CDC34;EIF5;STK25;PRPF3;IRF1;AGO2;SQSTM1;ATF3;NUP58 Oxidative Phosphorylation 43/200 0.736629041989606 0.999993155496853 0 0 0.90809589124773 0.277578441746925 ACADVL;NDUFB8;MTRR;RETSAT;ABCB7;ECI1;ETFDH;DLST;HTRA2;RHOT2;MTRF1;RHOT1;OPA1;NNT;IDH3B;MFN2;ATP6V1H;COX11;PMPCA;ACAA1;NDUFV1;COX10;TOMM70;HSPA9;PDHX;CPT1A;NQO2;PHYH;IDH1;IMMT;ATP1B1;ACADSB;LRPPRC;CS;PDP1;SUPV3L1;AFG3L2;GLUD1;POR;OGDH;NDUFS2;NDUFS1;SLC25A12 Allograft Rejection 43/200 0.736629041989606 0.999993155496853 0 0 0.90809589124773 0.277578441746925 GCNT1;NCF4;LY75;BRCA1;HIF1A;ETS1;IL27RA;IKBKB;IL18RAP;ST8SIA4;AKT1;FLNA;APBB1;JAK2;IL12RB1;MAP3K7;SOCS5;MAP4K1;IFNAR2;IL4R;PRKCB;IFNGR1;IL15;GALNT1;F2R;GLMN;TRAF2;IL2;TAPBP;TLR1;ZAP70;CD4;IRF4;ELF4;IL2RA;ABI1;CD28;IRF7;HCLS1;FAS;CD47;EIF4G3;EIF3A Hedgehog Signaling 7/36 0.760518355125693 0.999993155496853 0 0 0.800769597900012 0.21921470687497 TLE3;CDK6;LDB1;RASA1;NF1;MYH9;PML Estrogen Response Early 42/200 0.789657959303377 0.999993155496853 0 0 0.881113615111535 0.208079729572826 KCNK5;SLC26A2;B4GALT1;ABHD2;SLC2A1;ABAT;SLC1A4;NADSYN1;ADD3;RASGRP1;TOB1;TMEM164;AFF1;AKAP1;UGCG;ABLIM1;FAM102A;INPP5F;MYB;NRIP1;LRIG1;JAK2;KDM4B;SLC16A1;SLC37A1;TGIF2;BCL11B;TIPARP;ELOVL5;SIAH2;AMFR;NCOR2;TIAM1;SLC7A5;MED24;MYBBP1A;FASN;BHLHE40;BCL2;UNC119;GLA;FKBP5 Complement 42/200 0.789657959303377 0.999993155496853 0 0 0.881113615111535 0.208079729572826 GMFB;DYRK2;USP16;PRDM4;CPQ;PREP;TNFAIP3;PSEN1;RASGRP1;PIK3CG;PIK3R5;DOCK10;DPP4;CASP9;PPP2CB;VCPIP1;AKAP10;GNG2;SPOCK2;LAMP2;STX4;FYN;RCE1;JAK2;CTSD;SH2B3;CD55;USP8;ERAP2;SIRT6;RBSN;DUSP6;EHD1;PDP1;ZEB1;XPNPEP1;GPD2;IRF1;IRF7;CD46;RAF1;HSPA1A Spermatogenesis 27/135 0.834915895676552 0.999993155496853 0 0 0.82868158123371 0.14951428008375 CLPB;IDE;PGS1;COIL;PRKAR2A;PHKG2;TOPBP1;ZC3H14;AGFG1;IL12RB2;TLE4;RFC4;PARP2;STRBP;CSNK2A2;BRAF;SIRT1;CHFR;MLLT10;IFT88;DBF4;CAMK4;RAD17;NF2;LPIN1;STAM2;EZH2 Apical Surface 7/44 0.911589786301226 0.999993155496853 0 0 0.627302908444777 0.0580664102847299 APP;B4GALT1;NCOA6;CROCC;ADAM10;BRCA1;ADIPOR2 Myc Targets V1 37/200 0.953713681078367 0.999993155496853 0 0 0.75134277571973 0.0356074694548388 EIF4A1;SF3B3;MCM7;CSTF2;SRSF1;CUL1;HNRNPU;DDX21;GSPT1;XPO1;TRIM28;TRA2B;ORC2;FAM120A;DHX15;TOMM70;NOP56;DDX18;SMARCC1;RFC4;NCBP1;NCBP2;IFRD1;CAD;CTPS1;SRPK1;GNL3;XPOT;HNRNPD;PRPF31;SNRPA1;ETF1;MCM6;TARDBP;SRSF7;KPNB1;EIF3B Estrogen Response Late 31/200 0.997226506289134 0.999993155496853 0 0 0.606122974015951 0.00168341380585112 KCNK5;SLC26A2;ABHD2;SLC1A4;ADD3;TOB1;AFF1;ZFP36;FAM102A;MYB;NRIP1;JAK2;JAK1;STIL;SLC16A1;ELOVL5;SIAH2;AMFR;METTL3;BATF;MAPK13;NCOR2;TIAM1;SLC7A5;DNAJC1;RABEP1;ID2;BCL2;SGK1;GLA;FKBP5 Pancreas Beta Cells 3/40 0.997783724468898 0.999993155496853 0 0 0.268611740521853 0.00059597829816338 DPP4;ELP4;FOXO1 Epithelial Mesenchymal Transition 29/200 0.999177222867015 0.999993155496853 0 0 0.560069230006786 0.000461001832238241 NOTCH2;COPA;SDC4;MCM7;WIPF1;PLOD3;TNFAIP3;PLOD1;ENO2;THBS1;GLIPR1;NT5E;SGCB;FLNA;QSOX1;COLGALT1;JUN;GADD45B;GADD45A;IL15;TPM1;P3H1;GEM;RHOB;TGFBR3;ID2;FAS;ITGA5;SNTB1 Apical Junction 28/200 0.99957560720314 0.999993155496853 0 0 0.537460402467551 0.000228142737897029 B4GALT1;PTEN;PIK3R3;WASL;TIAL1;AKT2;EPB41L2;TSPAN4;SYMPK;DHX16;STX4;PLCG1;MAP4K2;ACTN1;ACTN4;TRAF1;MAPK14;MAPK13;CDK8;ADAM15;RASA1;NF1;MYH9;EVL;MVD;NF2;NECTIN3;ARHGEF6 Angiogenesis 1/36 0.999921642339941 0.999993155496853 0 0 0.0946251157050293 7.41489316011554e-06 APP Myogenesis 24/200 0.999975854690701 0.999993155496853 0 0 0.449701047812617 1.0858301980755e-05 EIF4A2;RB1;MEF2A;APP;GADD45B;ACSL1;DAPK2;SPHK1;AGL;IFRD1;PSEN2;PDE4DIP;SIRT2;ABLIM1;MYO1C;AKT2;BHLHE40;PICK1;MYH9;KIFC3;LPIN1;SPTAN1;MEF2D;SH2B1 KRAS Signaling Dn 23/200 0.999987041314523 0.999993155496853 0 0 0.428407485875706 5.55163383647846e-06 BTG2;CAMK1D;DTNB;GTF3C5;SPHK2;IDUA;CLSTN3;ZBTB16;MX1;MTHFR;PTPRJ;CDKAL1;TENT5C;MFSD6;FGGY;VPS50;SIDT1;SLC16A7;ASB7;COQ8A;SGK1;SKIL;SLC29A3 Coagulation 12/138 0.999993155496853 0.999993155496853 0 0 0.314291899916494 2.15117925994945e-06 DPP4;CASP9;ANXA1;CPQ;USP11;LAMP2;PREP;FURIN;FYN;THBS1;SIRT2;DUSP6